In der Vertiefung Mensch-Umwelt Systeme geht es um die Integration von naturwissenschaftlichen mit sozialwissenschaftlichen Modellen. Es werden Systeme betrachtet, deren Energie- und Stoffflüsse oder deren Zustände und Qualität entscheidend durch den Menschen geprägt sind (z.B. Energie- und Mobilitätssysteme, Abfallsysteme, Wald- und Landschaftssysteme). Diese können in Industrie- wie auch in Entwicklungsländern beheimatet sein.

Die Studierenden sollen einerseits lernen, diese Flüsse und Zustände qualitativ und quantitativ zu erfassen und zu bewerten. Andererseits sollen sie sich mit den natürlichen und gesellschaftlichen Regelmechanismen auseinandersetzen. Analysiert wird die Wechselwirkung zwischen dem Menschen und seiner Umwelt. Dabei werden nicht nur die Einflüsse des Menschen auf die natürliche Umwelt, sondern auch die Rückwirkung einer durch den Menschen veränderten Umwelt auf das Humansystem untersucht. Die Dynamik dieser Wechselwirkung wird durch ein Spektrum zeitlicher und räumlicher Skalen bestimmt, welche mit den verschiedenen Organisationsebenen des biologischen bzw. sozialen Systems assoziiert sind (Zelle, Organ, Individuum, Art, Ökosystem bzw. Individuum, Gruppe, Organisation, Gesellschaft).